運輸署今日表示，為配合重建後的皇崗口岸投入服務並24小時運作，將實施相應交通和公共運輸安排，為市民和旅客提供便利、暢順的出行體驗。
皇崗口岸設七條專營巴士、六條專線小巴和五條24小時運作短途跨境巴士路線，直達港九新界各區。其中，專營巴士線途經九個港鐵站和四個巴士轉車站，便利轉乘鐵路或巴士前往各區。運輸署呼籲跨境人士注意各路線在日間和通宵時段的服務時間，選擇合適路線往返新口岸。
運輸署已增設由粉嶺公路和新田公路直達新深路的公共運輸專用車道，讓專營巴士、專線小巴和跨境巴士使用前往新口岸，無須駛經新田交匯處，提升往返口岸的效率。該署會連同公共運輸營辦商密切留意乘客需求，有需要時加強或調整服務。
運輸署副署長（公共運輸事務及管理）郭惠英今日會見傳媒時表示，運輸署已連同深港兩地口岸部門和公共運輸服務營辦商為不同情況制定應變方案。具體而言，營辦商會預留後備司機和車輛，當人流顯著增加、特別是回港高峰時段，停在口岸附近緩衝區的後備巴士可在兩分鐘內抵達口岸接載乘客，盡快疏導人流。另外，巴士公司可在人流最高峰時段安排特別短途班次，加快巴士流轉。
的士方面，空載市區和新界的士，以及已有預約行程的車隊的士司機須先於公交緩衝區取籌，分別按序前往口岸公共運輸交匯處的士站，以及車隊的士專屬上客區接載乘客。已預約車隊的士的乘客應先到相關服務站，向車隊的士大使展示已預約的車隊的士車輛登記號碼作登記。車隊的士大使會動態調度於公交緩衝區輪候的的士前往專屬上客區，確保已預約的乘客盡快順利登車。
此外，口岸大樓設有大型公共交通資料一覽表和站點顯示屏，營辦商會派員手持指示牌引導乘客上車。運輸署也會在口岸開通初期安排服務大使協助使用者選取最合適路線前往市區。
運輸署強調，新皇崗口岸投入服務初期，附近交通可能會較繁忙。市民應按需要使用其他陸路和鐵路口岸往返深圳與香港，不必急於使用新口岸過關。需要使用皇崗口岸的跨境人士應提早計劃行程，預留時間適應新安排。